对DIA初步了解后，奉上“新宠”DIA与脂质组学联合的高分文章，读完之后，不得不感叹这是一篇思路特别清晰、结构特别完整并且还很有意思的文章！快来一起围观吧，感兴趣的朋友可以去看看原文哦~
IntegratedLipidomicsandProteomicsPointtoEarlyBlood-BasedChangesinChildhoodPrecedingLaterDevelopmentofPsychoticExperiences:EvidenceFromtheAvonLongitudinalStudyofParentsandChildren
研究背景识别精神疾病的早期生物标志物是很有意义的，因为对那些有未来精神障碍风险的患者的早期诊断和治疗与改善预后很重要的作用。本研究调查了“埃文亲子纵向研究”志愿者的早期脂质组学和凝血途径蛋白组学。
样本选择12岁儿童血浆样本：PEs组(n=48)，对照组血浆样本(n=67)。
研究方法DIA蛋白组学+脂质组学
发现挖掘了脂质类溶血磷脂酰胆碱(n=11)、磷脂酰胆碱(n=61)及凝血途径蛋白(n=22)，并将这些数据与已有的补体途径蛋白数据进行了整合。
研究思路结果展示1.12岁时的早期PEs特征分子（DIA蛋白组+脂质组）
对48名PEs组和67名对照组的12岁儿童的血浆进行脂质组学和DIA蛋白组学分析，得出潜在生物标志物的脂类数据集包括61个PCs和11个LPCs，PCs和LPCs是研究的重点。DIA蛋白质组学结果中，KEGG分析显示有22个蛋白在凝血途径中被鉴定到。进一步单因素分析显示，PEs与健康对照组共存在34种分子脂质和3种凝血蛋白的差异(表1)。经校正后，16种脂类和1种蛋白PLG仍显著升高。多变量分析中，偏最小二乘判别分析的结果是一个模型((R2Y=0.3)，有趣的是，在单独进行的单变量和多变量分析之间有很强的一致性。表1对照组与PEs组间血浆脂质和蛋白的差异
2.脂质组学和蛋白质组学整合
凝血和补体途径蛋白在功能上密切相关，因此，在脂质和蛋白质的综合分析中纳入了总数据集中可用数据的补体蛋白。相关分析显示，17种脂类与6种蛋白(PLG、肝素辅因子2、补体C2、补体因子H、凝聚素、vitronectin)呈正相关，其相似度评分高于0.3。凝血蛋白PLG、肝素辅因子2和补体途径蛋白vitronectin与16种脂质呈强阳性关系（图1）。相关网络图显示了在补体蛋白、补体C2和补体因子H中观察到的其他次要连接。有趣的是，PLG的连接数量最多，其次是vitronectin和肝素辅因子2(图2)。图1蛋白质组和脂类组相关强度
图2蛋白与脂质分子的关联性及关联强度
3.数据聚类分析
为了检测研究人群中潜在的代谢表型，KODAMA算法应用于所有有临床数据的个体(n=90)。然后，对感兴趣基因集群周围的分区做KODAMA评分，来识别本研究人群中潜在的相似表型。根据最高的silhouette中值，确定了四个不同的簇(图3)，分别命名为A、B、C、D，聚类间PEs有显著差异。图3(A)围绕medoids的划分轮廓图;(B)根据计算出的轮廓平均值进行聚类
此外，BMI和性别在各组间均无统计学意义（表3），同样，抑郁状况和社会阶层在各组间也无显著差异(两个变量p.05，数据未显示)。表3BMI与性别无统计学意义
对聚类的进一步研究表明，聚类D具有很高的发生PEs的可能性。该簇的PEs发生率为71%，而簇A、簇B、簇C的PEs发生率分别为42%、29%、19%。检查胆固醇数据与结果KODAMA评分之间的关系，9个胆固醇参数与聚类有显著相关性。综上所述，簇D代表一种代谢表型，发生PE的概率较高。结论研究结果为12岁健康但18岁确认PEs的受试者在蛋白质和脂质标记提供了证据，这些不一定只针对PEs，因为之前已经观察到在12岁以后发展为PD的受试者中出现了重叠的变化，也观察到与糖尿病前期、肥胖、他代谢疾病障碍相关，表明这些疾病有共同的发展起源，虽然在代谢紊乱和精神分裂症方面的文献有不一致的地方。
研究中强烈提示，在18岁时报告PE受试者的脂质组和蛋白质组，在12岁时已经发生了改变，这表明代谢失调可能导致PE的早期脆弱性，并提示这些溶血磷脂酰胆碱，磷脂酰胆碱和凝血之间的串扰，这涉及到脂质体和蛋白质组之间分子间的相互联系。
参考文献IntegratedLipidomicsandProteomicsPointtoEarlyBlood-BasedChangesinChildhoodPrecedingLaterDevelopmentofPsychoticExperiences:EvidenceFromtheAvonLongitudinalStudyofParentsandChildren.[J].Biologicalpsychiatry,,86(1).
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